No sé exactamente que tipo de monitoreo necesitas, si unicamente consumo de ancho de banda por dispositivo, consumo por aplicación, si estás monitorizando algún servidor tipo http...
Tampoco sabemos la tiopología de tu red, si existen muchas máquinas, como está configurado el enrutador o switch, si el server windows 2003 hace de bridge a otras máquinas o simplemente está conectado a la red etc.
Para Pardus existe el apquete RRDtools (su web
http://oss.oetiker.ch/rrdtool/index.en.html) es similar a mrtg.
Para capturar todo el tráfico que pase por una red debes poner tu tarjeta en modo "promiscuo", eso es simple pasándole el parámetro -promisc al "ifconfig".
Suponiendo que tu tarjeta de red es "eth0" en modo root haces:
#ifconfig eth0 promisc
Entonces tu tarjeta de red capturará todo el tráfico que pase por la red en la cual estás conectado pero, si hay algún switch que filtre el tráfico, obviamente no vas a poder verlo de no ser que esté configurado para replicarlo a toda la red, no se como es tu red.
A partir de ahí y buscando información sobre como trabaja "rrdtool" pues ya puedes empezar a generar gráficas y recopilar información.
Si quieres conocer si la tarjeta de red del windows 2003 server está en modo promiscuo (siempre que no esté configurado para filtrar cierto tipo de paquetes...) nmap y dsniff pueden ayudarte a conocer como es la red donde te encuentras... pero ¡ojo!, como el admin detecte que estas monitorizando la red puede cortarte la cabeza jajajajajajajaj.
Otro paquete que existe en Pardus es "nfdump" con un frontend web que se llama "nfsen" aunque no está en Pardus este último creo.
http://nfsen.sourceforge.net/.
no sé exactamente que quieres hacer pero si pones en modo promiscuo tu tarjeta de red y haces un simple "tcpdump" ya vas a "ver" muchas cosas...
PD Me olvidaba. Si tu red es wifi las cosas cambian, ya dirás algo.